Гений, хоть и хулиган, школьник 10 класса Кайто Даймон, вовсе не думает об учебе, его интересуют лишь загадки и головоломки. Он бы вообще не появлялся на предметах, но наверно по счастливому случаю, к нему привязалась подруга детства Ноноха Ито - энергичная девушка, переживающая, заботащаяся о Кайто.

Академия «Квадратный корень» полна, озабоченных головоломками и пазлами, школьниками. Президент школьного совета и клуба головоломок Содзи Дзикукава, был удивлен и озадачен самим Даймоном. Так Содзи решил проверить парня, отправил его в смертельный лабиринт, пройдя который, благодаря Нанохи, он получил «контракт Орфея» - Божественный механизм, который позволяет использовать мозг человека по максимому, под название «фи брэйн».

Кайто – один из Решателей, немногих избранных, способных справиться с замашками всемирной тайной организации, изобретающей все новые неразрешимые загадки. Под боевым псевдонимом Эйнштейн и в компании с верной Нонохой главный герой начинает жизнь в среде, где не признают громких слов и дутых авторитетов. Положение в иерархии Решателей надо завоевывать и доказывать делом, щелкая, как орешки, все новые задачки и приближаясь к «мистерии Бога». Это говорит о том, что остается отгадать еще не мало загадок.